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Text File  |  1995-03-04  |  1.6 KB  |  35 lines

  1. **************************************************
  2. * N-4 cytosine-specific DNA methylases signature *
  3. **************************************************
  4.  
  5. N-4 cytosine-specific  DNA methylases (EC 2.1.1.113) [1,2]  are  enzymes  that
  6. specifically  methylate  the  amino  group at the C-4 position of cytosines in
  7. DNA. Such enzymes are found as components of type II  restriction-modification
  8. systems in prokaryotes.  Such enzymes recognize a specific sequence in DNA and
  9. methylate a cytosine in that sequence.    By this action they protect DNA from
  10. cleavage by type II restriction enzymes that recognize the same sequence.
  11.  
  12. Type II N-4 Mtases seem to be  structurally  and  enzymatically related to N-6
  13. adenine-specific DNA methylases.  Like the N-6 Mtases they contain a conserved
  14. Pro-Pro-Tyr/Phe region,  but the N- and C-terminal contexts of this region are
  15. sufficiently different  to derive a consensus pattern specific to this type of
  16. enzymes.
  17.  
  18. -Consensus pattern: [LIVMF]-T-S-P-P-[FY]
  19. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  20. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: O'Nyong-Nyong  virus  nonstructural
  21.  polyprotein and fission yeast rad16.
  22.  
  23. -Expert(s) to contact by email: Roberts R.J.
  24.                                 roberts@neb.com
  25.                                 Bickle T.
  26.                                 bickle@urz.unibas.ch
  27.  
  28. -Last update: June 1994 / Pattern and text revised.
  29.  
  30. [ 1] Tao T., Walter J., Brennan K.J., Cotterman M.M., Blumenthal R.M.
  31.      Nucleic Acids Res. 17:4161-4175(1989).
  32. [ 2] Klimasauskas S., Timinskas A., Menkevicius S., Butkiene D., Butkus V.,
  33.      Janulaitis A.
  34.      Nucleic Acids Res. 17:9823-9832(1989).
  35.